يخضع المركز لمجلس إدارة يضم وزير الثقافة اللبناني رئيسا او من ينوب عنه، ومدير عام اليونسكو او من ينوب عنه، الى جانب سبع شخصيات بارزة من المجتمع الدولي. يتم تعيين تلك الشخصيات ومن بينها اثنان يحملان الجنسية اللبنانية، بعد استشارة مدير عام اليونسكو  من قبل وزير الثقافة اللبناني، لمدة خمس سنوات قابلة للتجديد.